Op CERN doet Nikhef onderzoek in de deeltjesfysica. Nikhef is onderdeel van de ATLAS, ALICE en LHCb collaboraties.
Bij (Advanced) Virgo doet Nikhef onderzoek naar Zwaartekrachtgolven.
Bij XENON100/1T bij Gran Sasso Science Institute doet Nikhef onderzoek naar Donkere Materie.
Bij de Pierre Auger Observatory doet Nikhef onderzoek naar kosmische stralen.
Nikhef doet onderzoek bij KM3NeT naar neutrino’s.
