SURF en Nikhef bieden experimenteel grafisch rekenen voor alle wetenschappers

15 oktober 2020

Vanaf deze maand heeft het SURF Open Innovation Lab (SOIL) een nieuw, experimenteel grafisch rekencluster geïntroduceerd, dat toegankelijk is voor alle Nederlandse wetenschappers. Het cluster is uniek in Nederland en staat bij Nikhef in Amsterdam.

Grafische processoren zijn oorspronkelijk ontwikkeld voor de game-industrie, waar snelle beeldverwerking essentieel is. Daarnaast worden GPU’s steeds vaker gebruikt voor wetenschappelijke berekeningen, waaronder astronomie, deeltjesfysica en andere veeleisende onderzoeksprojecten.

Sinds 2018 heeft SURF een langdurige relatie met AMD om te experimenteren met de meest geavanceerde technologieën van het bedrijf. Het huidige project wordt ook uitgevoerd in samenwerking met het Nederlands Nationaal instituut voor subatomaire fysica (Nikhef). Het systeem wordt gehost op het Nikhef en vormt het hart van deze nieuwe rekenkundige samenwerking van experimenteel onderzoek.

‘Een belangrijke doelstelling van SURF is het evalueren van nieuwe ICT-concepten en -technologieën om de bruikbaarheid en toepasbaarheid voor onderzoekers te bepalen’, aldus SURF’s IT-consultant Sagar Dolas. ‘Door te experimenteren met innovatieve technologieën ontdekken we nieuwe mogelijkheden om het onderzoek in Nederland te versnellen.’

‘We zien dit als een win-win situatie voor alle betrokken partijen’, zegt Nikhef’s IT-architect Tristan Suerink. ‘AMD zal waardevolle feedback krijgen van real-world onderzoeksprojecten in de wetenschappelijke wereld en tegelijkertijd de kritische eisen van onderzoekers ontdekken. Vanuit ons perspectief profiteren we van de toegevoegde waarde van het gebruik van innovatieve, op versnellers gebaseerde technologieën op onze werklast, waardoor onze wetenschappers hun berekeningen vooruit kunnen helpen dankzij de prestaties van de GPU’s van AMD.’

‘Ontworpen om hoge prestatieniveaus te leveren, zijn we verheugd dat AMD-versnellers SURF en het Nikhef-datacentrum in staat stellen om lopend wetenschappelijk onderzoek binnen een open, flexibel ecosysteem te ondersteunen’, aldus Brad Mccredie, Corporate Vice President, Data Center GPU en Accelerated Processing, AMD. ‘AMD Radeon Instinct, ondersteund door de AMD-software voor open ecosystemen, biedt uitstekende prestaties op het gebied van wetenschappelijke workloads met een zeer parallelle computerarchitectuur.’

SURF biedt toegang tot de landelijke computerfaciliteiten voor onderzoek en onderwijs in Nederland. ‘We zijn benieuwd hoe het Nederlandse onderzoek kan profiteren van de nieuwste GPU’s van AMD. Het project, dat al een jaar in voorbereiding is, is voor SURF een mooie kans om meer ervaring op te doen met verschillende computermethoden’, aldus Sagar Dolas.

‘Of het nu gaat om kunstmatig intelligentie of experimenteel onderzoek, we begrijpen dat er een kritische behoefte is om meer data te verwerken. We willen dit op een effectieve en duurzame manier doen en verwachten dat grafische processoren een belangrijke rol zullen spelen in de toekomst.’

In de eerste weken van het project hebben Nikhef-onderzoekers al kennis gemaakt met het nieuwe cluster. Ze zijn betrokken bij het LHCb-deeltjesexperiment van CERN, dat vorige maand besloot te beginnen met grafische berekeningen, waarbij de technologie van AMD direct buiten de poort op de proef werd gesteld.

De verwachting is dat het gebruik van grafische berekeningen de komende jaren op grote schaal zal blijven evolueren in het wetenschappelijk onderzoek. ‘Hoewel er nog meer tests nodig zijn, hopen we een sprong voorwaarts te maken door dit experimentele cluster en de bijbehorende ondersteuning, inclusief training en workshops, aan te bieden’, vervolgt Sagar Dolas.

‘Vanuit de afdelingen astronomie, chemie en biologie zien we de belangstelling voor deze innovatieve aanpak als informaticamiddel snel toenemen. Deze grafische kaarten worden bijvoorbeeld gebruikt om methodes te ontwikkelen voor het sneller vinden van nieuwe COVID-19-medicijnen.’

Het nieuwe GPU-cluster staat nu open voor alle Nederlandse onderzoekers. Toegang kan worden aangevraagd via https://www.surf.nl/en/get-access-to-experimental-systems.